تتميز اقسام الجراحة الخاصة والباطني الخاص في المستشفى التخصصي بتجهيزاتها الطبية المتقدمة وبكوادرها الفنية المؤهلة للتعامل مع الحالات الباطنية والجراحة .

ويتم بهذه الأقسام :

1. معالجة وجراحة أمراض العمود الفقري .
2. معالجة وجراحة الدماغ والأعصاب .
3. معالجة وجراحة المسالك البولية والتناسلية .
4. معالجة وجراحة العظام وتركيب المفاصل .
5. معالجة وجراحة الجهاز الهضمي بالمنظار .